La Ciudad de los Mendigos
Ambos debatieron cómo él podía aplicar su don sanador. Eventualmente, se decidió que Mikao iría a la ciudad de los mendigos en Kioto, para ayudar a los pobres y los desamparados a vivir vidas mejores. Se dijo que trabajó allí durante siete años.

Kenneth Ch’en, en El budismo en China, y Alexander Soper en Evidencia literaria del arte primitivo budista en China, sostienen a la vez la idea de que en el budismo hay una fuerte presencia persa iraní. Kenneth Ch’en destaca que la trinidad de Amitaba es similar a la trinidad de la deidad persa Zurvan.

Esta parte de la historia podría indicar que la filosofía zen del vivir en el ahora, desapegado de la emoción y de los resultados de la acción, es una filosofía compatible con Reiki. Cuando recorremos el sendero de nuestra vida es mejor acordarse de vivir en el presente, día a día, en vez de estar siempre mirando hacia el futuro en pos de algo mejor o hacia el pasado con pesar. El zen es también una forma de meditación que puede ser una herramienta para asistirnos durante la travesía.

El Monasterio Zen
Finalmente, Mikao Usui llegó a un monasterio zen de Kioto donde fue invitado a permanecer y estudiar. El abad creía que si alguien se dedicaba auténticamente y no se daba por vencido, finalmente hallaba lo buscado. El abad también creía que si algo fue conocido alguna vez, puede ser conocido nuevamente.